Monitoring quotidien COVID-19

Le fil d’actualités

14/05/2020	Ce 14 mai nous avons passé le cap symbolique des 10 000 morts en EHPAD depuis le début de la pandémie. Pour la première fois également, selon les chiffres qui nous sont communiqués, le nombre de morts en EPHAD a été supérieur celui des morts à l’hôpital. Nos aînés continuent de payer un lourd tribut à la COVID-19.
08/05/2020	Création d’un nouveau graphe pour estimer l’impact de la COVID-19 sur la surmortalité par rapport aux années précédentes (voir Comparaison des décès par rapport aux années précédentes)
07/05/2020	Quelques points à retenir de la conférence du premier ministre : carte des Indicateurs de l’activité épidémique ; ⁃ Disparition de la couleur orange, apparition du troisième critère : couverture des besoins en tests ⁃ La carte est uniformément verte pour ce troisième critère, il n’est donc pas discriminant à l’heure actuelle. ⁃ c’est à l’échelle de la région que s’effectue la synthèse des trois critères. 2 régions, Mayotte et l’Île de France connaîtront des procédures de déconfinement plus strictes en raison de leurs situations particulières.
06/05/2020	Appel de Vincent Lindon : « Comment ce pays si riche… »(10) ici
05/05/2020
04/05/2020
03/05/2020	Hospitalisations et réanimations en baisse constantes, nous reviendrions à une situation moins exceptionnelle, le calme qui précède la tempête du déconfinement ?
02/05/2020
01/05/2020	Suite aux polémiques soulevées par la première version, la carte de l’activité épidémique a bien verdi. A-t-on déplacé la cible afin qu’elle atteigne la flèche ?
30/04/2020	Présentation de la première carte des départements. Elle prend en compte 2 des 3 critères annoncés par le premier ministre : – capacité en réanimation – circulation du virus manque encore la capacité à réaliser les tests virologiques
29/04/2020	Le curieux recul du cumul des cas confirmés de COVID-19 dans les chiffres de Santé Publique France du jour, nous rappelle que ces données sont en cours de consolidation. Ce sont donc moins les valeurs absolues que les tendances et les évolutions qu’il faut considérer d’où l’intérêt de notre travail quotidien
28/04/2020	Le département devient l’unité géographique du déconfinement. Une carte de déconfinement par département sera mise en place à partir du 30 avril. Si les indicateurs demeurent au vert, à partir du 11 mai les commerces rouvriront en devant respecter les règles de distanciation, les écoles maternelles puis élémentaires rouvriront pour que les parents puissent aller au travail. Le télétravail reste encouragé, dans les cas où il n’est pas possible le travail en décalage est recommandé. Les masques, soudainement devenus efficaces, seront obligatoires dans les transports en commun et recommandés dans de multiples situations. Les tests virologiques vont être déployés à raison de 700 000 par semaine, toute personne testée positive sera confinée. Une fois développée, l’application StopCovid sera présentée au parlement qui aura le droit de l’approuver. Dans ce régime pudiquement qualifié de « Liberté avec exceptions » une loi sera votée pour permettre à du personnel non-médical d’avoir accès à nos données de santé.
27/04/2020	Les indicateurs démontrent l’efficacité de la stratégie du confinement sur la gestion de la saturation des urgences. Mais cette situation ne peut pas durer, il va falloir passer au déconfinement et les régions lestions atteintes aujourd’hui risquent de devenir les plus vulnérables demain.
26/04/2020	À Wuhan en Chine, le confinement a duré 76 jours, nous sommes donc à Wuhan -36
25/04/2020	Dans son point d’information du 24 avril l’INSERM(6) évoque une étude d’une équipe de chercheurs chinois sur des tests de détections des anticorps(7). Nous aurons besoin de type d’indicateurs pour contrôler le déconfinement.
24/04/2020
23/04/2020	Selon l’étude Institut Pasteur parmi les patients qui décèdent à l’hôpital, 15 % décèdent rapidement (moins d’un jour après leur admission) et 85 % dans un délai plus long (13,2 jours en moyenne). Ces données ne varient pas en fonction de la tranche d’âge ni du sexe de la personne contaminée. On peut donc en déduire qu’il y a un décalage de deux semaines entre un événement qui affecte l’entrée en réanimation et son impact sur le nombre de décès.
22/04/2020	Selon une étude conjointe Institut Pasteur/CNRS/INSERM publiée le 20 avril (5), 6 % de la population française aurait été contaminée par le SARS-CoV-2. On estime qu’il faudrait que 60 à 70 % de la population aient été en contact avec le virus pour que l’immunité de groupe soit acquise. Pendant le confinement, un malade infecte en moyenne 0,5 personne contre 3,3 avant le confinement.
21/04/2020	Confirmation de la légère tendance à la baisse des hospitalisations et des réanimations.
20/04/2020	Le plateau avec une légère tendance à la baisse des indicateurs se confirme. Le nombre d’entrées en réanimation est en baisse depuis 12 jours consécutifs, mais le nombre de patients très au-dessus de la normale maintient ces services en très forte tension.
19/04/2020	Pas d’évolution significative des indicateurs. Au sujet des masques, on retiendra la leçon de logistique du premier ministre lors de sa conférence de presse : – un stock s’épuise plus vite en période de surconsommation qu’en période de consommation normale – Une consommation plus élevée que la production conduit à un manque – Dépendre d’un seul fournisseur peut être critique en cas de défaillance de celui-ci Une bonne nouvelle tout de même, les visites de nos aînés en EHPAD pourront reprendre.
18/04/2020	Peu d’évolution du côté des indicateurs, l’information du jour nous vient d’EDF qui garantit la fourniture d’énergie à l’ensemble de ses clients particuliers et suspend, jusqu’au 1er septembre 2020, toute réduction ou interruption d’énergie ainsi que toute pénalité de retard.
17/04/2020	Situation stationnaire, nous demeurons sur un plateau. Sur cette dernière semaine, les variations en positif ou en négatif sont de l’ordre de 1 % pour les hospitalisations et 4 % pour les présences en réanimation ou les décès. Autant dire rien de significatif.
16/04/2020	Pas d’évolution notable des indicateurs ce jour, nous semblons nous être installés sur un plateau. Une remarque toutefois, les décès en EHPAD et ESMS représentent quasiment la moitié des décès quotidiens au lieu d’un quart en période normale.
15/04/2020	Pour la première fois le nombre de patients hospitalisés diminue, le nombre de patient en réanimation marque sa plus forte baisse et nombre de retours au domicile atteint également son plus haut score.
12/04/2020	Le traçage des personnes au moyen d’une application installée sur les téléphones portables personnels n’est pas sans présenter des problèmes d’ordre technologique, méthodologique et éthique. La monétisation des données de santé est parmi les plus fortes dans le monde des big datas et risque donc d’attirer nombre d’acteurs pas forcément bien intentionnés. L’atteinte à la protection de ces données personnelles d’une telle application pose un réel problème d’ordre éthique.
10/04/2020	Le choix du confinement massif pour étaler dans le temps l’arrivée de nouveaux malades en réanimation retarde la survenue de l’immunité globale et donc le top départ du déconfinement.
09/04/2020	Le choix du confinement massif pour étaler dans le temps l’arrivée de nouveaux malades en réanimation retarde la survenue de l’immunité globale et donc le top départ du déconfinement.
08/04/2020	Amélioration globale des indicateurs, absence de relevé des décès en EHPAD. Rappelons que bien que les services de réanimations aient considérablement augmenté leur nombre de lits, ils sont toujours bondés
07/04/2020	Notre société n’aime pas les vieux et elle fait payer le prix fort à nos aînés qu’elle laisse mourir dans nos Ehpad. Monitoring des données hospitalières relatives à l’épidémie de COVID-19 réalisé à partir des données quotidienne fournies par Santé Publique France.

carte des indicateurs de l’activité épidémique

Pour avoir les données officielles à jour, consultez le site du Ministère des solidarités et de la santé(9).

Les cas confirmés de COVID-19

Faute de masques, de tests de détections et de vaccins en nombres suffisants, la France a été contrainte d’adopter une stratégie de confinement massif de toute sa population afin de réduire la vitesse de propagation de la pandémie sur son territoire. En l’absence d’une telle mesure nous aurions risqué de voir une évolution exponentielle du nombre de malade (courbe rouge ci-contre) en comparaison à l’évolution que nous constatons effectivement (courbe bleue). Faute de ces mesures, l’afflux de malades dans les hôpitaux et services de réanimation aurait été tel que les établissements et le personnel hospitalier n’auraient pu y faire face. Réduire la vitesse de propagation de la maladie est donc une donnée primordiale pour assurer la capacité à prendre en charge tous les malades en phases aigüe.

Les malades de la COVID-19 hospitalisés

Contrôler le nombre des malades pris en charge par l’hôpital et ses services de réanimation est un indicateur important de notre capacité à faire face au flux de malades. La saturation de ces services se traduirait inévitablement par un accroissement du nombre de décès.

la répartition des malades en réanimation dans les régions

La fréquentation des urgences en période de COVId-19

Le nombre de passages aux urgences a quasiment été divisé par deux depuis le début de la pandémie. La baisse importante s’est déroulée pendant la semaine qui a précédé le passage au stade 2 de la lutte. Actes civiques, pour ne pas encombrer inutilement les urgences, ou crainte d’aller aux dans un lieu perçu comme celui de tous les dangers ?
Sur les deux dernières semaines, les courbes du nombre de passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 et celle du nombre d’hospitalisations parmi les passages aux urgences pour suspicion de COVID-19 sont quasiment parallèles. Le taux d’hospitalisation pour suspicion de COVID-19 après passage aux urgences pour cette même suspicion est stable à41 %

Excès de mortalité

Comparaison des niveaux de mortalité par rapport aux années précédentes.
ces niveaux se répartissent comme suit :

1 = Pas d’excès

2 = Excès modéré

3 = Excès élevé

4 = Excès très élevé

5 = Excès exceptionnel

Comparaison des décès par rapport aux années précédentes

Nous manquons d’indicateurs sur les victimes de la COVID-19 à décédées à leur domicile. Pour combler un peu ce vide, nous avons évalué la surmortalité survenue en regard des décès liés à la COVID-19 sur mois de mars et avril 2020 par rapport aux deux années précédentes. Nous avons pour cela croisé des données de l’INSEE et de Santé Publique France.
On constate bien une surmortalité sur les semaines 13, 14, 15 et 16 par rapport aux années précédentes., mais les chiffres de surmortalité et de décès liés à la COVID-19 ne présentent pas de différences significatives.
On meurt de moins en moins à son domicile aujourd’hui, on peut donc penser que les personnes qui auraient vécu la maladie à leur domicile auraient été hospitalisées pour leurs derniers instants et de ce fait leur décès serait identifié dans les morts du COVID-19 à l’hôpital.
Peut-être font-elles partie des 15 % de personnes qui décèdent la journée de leur admission en réanimation de l‘étude de l’Institut Pasteur du 20 avril(5).
Le sujet mériterait d’être approfondi.

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références

1.Données hospitalières relatives à l’épidémie de COVID-19 – data.gouv.fr. /fr/datasets/donnees-hospitalieres-relatives-a-lepidemie-de-covid-19/.

2.Data.gouv. Tableau de bord COVID-19. Tableau de bord COVID-19https://dashboard.covid19.data.gouv.fr.

3.Data.gouv. Données des urgences hospitalières et de SOS médecins relatives à l’épidémie de COVID-19 – data.gouv.fr. https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-hospitalieres-relatives-a-lepidemie-de-covid-19/.

4.Géodes – Santé publique France – Indicateurs : cartes, données et graphiques. https://geodes.santepubliquefrance.fr/#c=indicator&f=0&i=covid_hospit.rea&s=2020-04-14&t=a01&view=map1.

5.Covid-19 : une modélisation indique que près de 6% des Français ont été infectés. Institut Pasteurhttps://www.pasteur.fr/fr/espace-presse/documents-presse/covid-19-modelisation-indique-que-pres-6-francais-ont-ete-infectes (2020).

6.Covid-19 : Point d’information Inserm – 24 avril 2020. Inserm – La science pour la santéhttps://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/covid-19-point-information-inserm.

7.Xiang, F. et al. Antibody Detection and Dynamic Characteristics in Patients with COVID-19. Clin Infect Dis doi:10.1093/cid/ciaa461.

8.Géodes – Santé publique France – Indicateurs : cartes, données et graphiques. https://geodes.santepubliquefrance.fr/#c=indicator&f=0&i=covid_xcdc_public.cat_zscore&s=2020-S14&selcodgeo=35&t=a01&view=map2.

9.DICOM_Jocelyne.M & DICOM_Jocelyne.M. Indicateurs de l’activité épidémique. Ministère des Solidarités et de la Santéhttp://solidarites-sante.gouv.fr/soins-et-maladies/maladies/maladies-infectieuses/coronavirus/etat-des-lieux-et-actualites/article/indicateurs-de-l-activite-epidemique (2020).

10.Arfi, F. Un appel de Vincent Lindon: «Comment ce pays si riche…». Mediaparthttps://www.mediapart.fr/journal/france/060520/un-appel-de-vincent-lindon-comment-ce-pays-si-riche.